La Superliga 09/10 estará compuesta por 24 equipos distribuidos en tres grupos de ocho. Se jugará un sistema de liga a doble vuelta y, conforme a los resultados de esa primera liga, se configurarán otros tres grupos, que jugarán por el sistema de liga a doble vuelta una segunda fase.

La composición de los grupos de la primera fase es la siguiente:

Grupo A: Ath. Club Bilbao, Transportes Alcaine, Real Sociedad, SD Lagunak, SD Eibar, Real Valladolid, Oviedo Moderno y UD Las Palmas.

Grupo B: Levante UD, RCD Espanyol, FC Barcelona, UD L´Estartit, Valencia Féminas CF, Gimnàstic de Tarragona, UD Collerense, Real Murcia CF.

Grupo C: Rayo Vallecano, At. de Madrid, AD Torrejón, Sp. de Huelva, Real Jaén CF, Sevilla FC, Club At. Málaga y CP Cacereño.

Los grupos de la segunda fase estarán compuestos por:

Grupo A: 1º Grupo A, 1º Grupo B, 1º Grupo C, 2º Grupo A, 2º Grupo B, 2º Grupo C, 1er. mejor tercero, 2º mejor tercero.

Grupo B: 3er tercero, 4º Grupo B, 5º Grupo A, 5º Grupo C, 2º mejor sexto, 7º Grupo A, 7º Grupo C, 8º Grupo B

Grupo C: 4º Grupo A, 4º Grupo C, 5º Grupo B, mejor 6º, 3er. sexto, 7º Grupo B, 8º Grupo A, 8º Grupo C

Una vez finalizada la segunda fase, el primero y segundo clasificado del Grupo A se enfrentarán en una eliminatoria a doble partido para la consecución del título de Campeón de Liga. Ambos equipos quedarán exentos de la primera eliminatoria de la Copa SM La Reina.

No se producirán descensos de Superliga a Primera Nacional pero sí ascensos a Superliga.

Los restantes clubes del Grupo A jugarán la Copa SM La Reina, junto con los tres primeros equipos de los grupos B y C. Los octavos de Final se jugarán conforme a unas tablas según clasificación que serán comunicadas.