Con motivo de la inclusión del Orihuela CF en el Grupo III de Segunda División B, el calendario de competición ha sido modificado. Los partidos del Levante UD B son los siguientes:
Jornada 1 (26-8-12) / Jornada 22 (13-1-13)
Levante UD B-UD Llagostera

Jornada 2 (2-9-12) / Jornada 23 (20-1-13)
CD Constancia-Levante UD B

Jornada 3 (9-9-12) / Jornada 24 (27-1-13)
Levante UD B-Ontinyent CF

Jornada 4 (16-9-12) / Jornada 25 (3-2-13)
CD Olimpic-Levante UD B

Jornada 5 (23-9-12) / Jornada 26 (10-2-13)
Levante UD B-Huracán CF

Jornada 6 (26-9-12) / Jornada 27 (17-2-13)
CD Alcoyano-Levante UD B

Jornada 7 (30-9-12) / Jornada 28 (24-2-13)
Levante UD B-Valencia Mestalla

Jornada 8 (7-10-12) / Jornada 29 (27-2-13)
Orihuela CF-Levante UD B

Jornada 9 (10-10-12) / Jornada 30 (3-3-13)
Levante UD B-RCD Espanyol

Jornada 10 (14-10-12) / Jornada 31 (10-3-13)
Descansa-Levante UD B

Jornada 11 (21-10-12) / Jornada 32 (17-3-13)
Levante UD B-Gimnastic

Jornada 12 (28-10-12) / Jornada 33 (24-3-13)
CF Badalona-Levante UD B

Jornada 13 (4-11-12) / Jornada 34 (27-3-13)
Levante UD B-CE L´Hospitalet

Jornada 14 (11-11-12) / Jornada 35 (31-3-13)
CD Binisalem-Levante UD B

Jornada 15 (18-11-12) / Jornada 36 (7-4-13)
Levante UD B-RCD Mallorca B

Jornada 16 (25-11-12) / Jornada 37 (14-4-13)
C. Atco. Baleares-Levante UD B

Jornada 17 (2-12-12) / Jornada 38 (28-4-13)
Villarreal CF B-Levante UD B

Jornada 18 ( 9-12-12) / Jornada 39 (28-4-13)
Levante UD B-Yeclano Deportivo

Jornada 19 (16-12-12) / Jornada 40 (5-5-13)
AE Prat-Levante UD B

Jornada 20 (22-12-12) / Jornada 41 (12-5-13)
Levante UD B-CF Reus Deportivo

Jornada 21 (6-1-13) / Jornada 42 (19-5-13)
UE Sant Andreu-Levante UD B